急性期的先选用对细菌敏感的药物(抗生素选择应按细菌培养及抗菌药物敏感试验来决定)静脉给药10天，常用药物为头孢菌素类、喹诺酮类、大环内酯类。均采用卧床休息3～4天，抬高阴囊，局部有红肿热痛的冷敷阴囊2～3天，必要时服止痛药，5天后开始热敷或热水坐浴，对疼痛不能忍耐的可局部1%利多卡因封闭。急性附睾炎后期及慢性附睾炎口服敏感抗生素(1个月)和附睾汤(配方：虎杖、萆解、夏枯草、乳香、没药、川芎、白芍、桃仁、当归、昆布、海藻，辨证分型治疗，每日1付煎服，治疗1个月为一疗程)。

因附睾炎有急性与慢性之分,所以治疗也有所侧重.对于急性附睾炎主张患者卧床休息,托起阴囊,以减轻疼痛.早期可将冰袋放在附睾处,防止肿胀.晚期可用热敷,以促进局部血运,加速炎症消退.因属于感染,故应进行抗感染治疗,临床上多选用广谱抗生素及对革兰氏阴性菌效果较佳的抗生素.对于疼痛,发热等全身症状,应用解热镇痛药对症处理.如果附睾疼痛较重可请专科医师予1％利多卡因10～20毫升由睾丸上端处行精索局部封闭,可起到止痛,解除坠胀作用.如果附睾炎性包块增大,阴囊皮肤红肿且有波动感,形成脓肿则须行切开引流.因留置导尿管招致本病者,应拔除尿管.另外,急性期期间要避免性冲动和重体力活动,以免加重感染和症状.对少数顽固病人且病情控制不理想,可行附睾甚至包括睾丸切除术.